[kotkovets]

Так правильней? »

Во первых перед каждой командой чтение реестра, нужно счищать принудительно флаг ошибки,
потому что, где то у вас скрипте установится 100% флаг ошибки, какой-нибудь командой, для правильной работы логики:

Код:

     ClearErrors
     ReadRegStr $2 HKLM "SOFTWARE\Classes\.${extenstion}" "Winamp_Back"  ;(читаем в $2 значение бэкапа) 
     ${If} ${Errors}
        ;----
     ${ElseIf} '$2' ==  '$ClassName'  # в $2 значение параметра  Winamp_Back
        ;---
     ${Else}
        ;----
     ${EndIf}

Во вторых, то ли вы в упор не видите очевидное,

Код:

ReadRegStr $2 HKLM "SOFTWARE\Classes\.${extenstion}" "Winamp_Back"  ;(читаем в $2 значение бэкапа) 
${If} ${Errors}
 #тут пишется код, если нету параметра Winamp_Back
DeleteRegValue HKLM "SOFTWARE\Classes\.${extenstion}" "Winamp_Back"

Зачем удалять значение параметра Winamp_Back которого не существует???
Учитесь читать код, а не, пардон, заниматься тупым копипастом!