[Mr dUSHA]

Второй этап можно зациклить, дабы система загрузилась под анимацией и по ее окончании получить готовый к работе рабочий стол. »

Можете проэкспериментировать с параметром реестра:
HKLM,SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Winlogon\Notify\Animator,Asynchronous
по-умолчанию он установлен в 0.
Установите его в единицу, и система будет загружаться параллельно с анимацией, но поверх анимации всплывет панель задач.
Чтоб панель задач не всплывала, можно в ее настройках снять галку "Отображать панель задач поверх остальных окон".

В текущей реализации анимация при логоне пользователя привязывается к юзерскому рабочему столу Default. На этом этапе я хотел запускать анимацию в специально созданном для этого отдельном рабочем столе, но проблема в том, что при запуске оболочки, система снова принудительно переключается на рабочий стол Default, а расковырять этот механизм до конца, и заблокировать это переключение руки пока не дошли...