Такое происходит, если кроме QEMU с iso файлами больше ни одно приложение не сопоставлено.
Сколько я не тестировал аддон на "живой" системе, у меня после этого ни разу с аддоном QEMU не производилась ассоциация iso файлов.
Это уже не аддон виноват, что Windows его начинает ассоциировать с iso файлами. Аддон лишь добавляет в контекстное меню свой пункт, но пунктом по умолчанию он не назначается. А вот если с iso файлами больше ни одно приложение не сопоставлено, тогда Windows производит ассоциацию iso с QEMU.
Попробуйте интегрировать аддон QEMU после аддона
7-zip, с ассоциацией его с iso.