Что делать с инфицироваными файлами?
 

DrWeb после проверки компа в безопасном режиме, нашел три инфицированых файла (Ipkey.exe, pskill.exe, TaskKillS.exe), все они расположены в папке C:\WINDOWS\system32. Что с ними делать? Можно просто удалить, или это повлияет на работоспособность системы? Заранее благодарен за ответ!..

По идее не должно повлиять. Занесите их в карантин. И удалите. (информации вы дали мало -что за система у вас ? и т.д.)

• Скачайте Malwarebytes Anti-Malware, установите, обновите базы, выберите Perform Full Scan, нажмите Scan, после сканирования - Ok - Show Results (показать результаты) - нажмите Remove Selected (удалить выделенные). Откройте лог и скопируйте в сообщение.
Если базы MBAM в автоматическом режиме обновить не удалось, обновите их отдельно. Загрузить обновление MBAM

И Выложите логи в соответствии с этими инструкциями. Так как могут быть ещё остатки.