windows 8.1 не заменяет одинаковые файлы в папке назначения, а добавляет новые
 

Доброй ночи. Первый раз сталкиваюсь с подобным: при переносе или копировании одноименных файлов, они не заменяются в папки назначения, а добавляются туда со словом "Ярлык" и порядковым номером в скобках. Как и где настроить привычную замену файлов при копировании, с запросом на подтверждение?

Возможно, залипает клавиша Alt - если ее удерживать, создается ярлык. Проверьте в безопасном режиме и желательно с другой клавиатурой.

Нет. Другой клавы не имеется, но с отключенной, при перетаскивании мышью - то же самое

Bolezn_Alzgamera,
Чистую загрузку сделайте и посмотрите, как дела с копированием.