Теряются ли 5 встроеных лицензий Windows Server CAL ?
 

Windows Server 2003 стоит в режиме лицензирования "На устройство или пользователя". Имеются соответствующие Server 2003 Device CAL.
Имею ли я право задействовать 5 встроенных Server CAL в рамках данной модели лицензирования ?

А почему нет? Если пробретен сервер в комплекте с Cal , то конечно можно при условии что он установлен в локальной сети.

Спасибо!
Вопрос №2. Эти 5 лицензий считать лицензиями на устройство или на пользователя ?

Как корабль назовешь, так и поплывет. Переименовть можно только раз, все лицензии в сети считаются одного типа, тем более что они одинаковы по цене.