Каким образом можно изменить запись в реестре при помощи *.reg файла, если сидишь за одним компьютером и меняешь запись в реестре сервера через сеть(доступ открыт)?

C помощью R-Admin или должно быть настроено удаленное управление реестром, тогда через regedit - подключить удаленный реестр

Верно.
Но если че напутаешь в реестре, перезагружайся под доской
и пиши scanreg /restore .
Удачи.