Часто при работе с антивирусами в отчетах появляется "ошибка ввода-вывода". Простите за вопрос, но что это такое - "ввод-вывод"? И чем грозят эти ошибки?

Если ошибка вылезает при работе антивируса - то скорее всего он орет на файл win386.swp - так ? Ничего страшного в этом нет, просто антивирусник не может получить монопольный доступ к файлу и все. Win386.swp - Файл подкачи windows.

Или орет ещё на какие-нить ?

win386.swp, о котором говорит, OpenX,  частный случай. Просто есть файлы блокированные системой (скажем exe какой-нибудь или dll) и к ним нельзя получить тот или иной вид доступа какой хочет антивирус. Лечится,  а точнее обходится запуском антивируса до загрузки основных приложений, когда число блокированных файлов мало.