На DVD в разных фрагментах периодически идет опаздывание изображения относительно звука. Но не везде. В каких-то фрагментах все в норме. Как можно исправить эту траблу? Может где что-то прочесть можно на эту тему?

Если это не софтовые проблемы, а проблемы диска - т.е. рассинхронизация наблюдается на одних и тех же местах, то в пределе потребуется ремастеринг диска. Как поправить в рипе - тоже дело на редкость муторное, но почитать можно
тут http://vcdrookie.com/rus/index.php?o...&Itemid=55
тут http://nickyguides.digital-digest.com/audio-synch.htm
тут http://vcdrookie.com/rus/index.php?o...55&topid=6
В любом случае потребуется ручками править все куски.

В статьях говорится насчет декодированных в *.avi  файлов, а у меня они в Мpeg-2. Или я что-то не догоняю?

Правильно. Но идеология работы сохраняется. Пр ремастеринге диска делается так - вытаскивается звук, берется что-то типа Vegas, подгоняется звук, запихивается обратно  в vob.  Пишется на болванку.
http://www.digiwo.com/video/dvd/dvd.php
http://vcdrookie.com/rus/index.php?o...&Itemid=55

Frame Rate подкрути чутка +/- несколько сотых  fps

Guest
Где ты предлагаешь его покрутить?

Guest 194.186.49.*
намек
Где вы собираетесь крутить fps на DVD? Не говоря о том, что ваш рецепт вообще не про то.