Создать запись в DNS
 

Нужно в DNS сервере создать запись, которая будет заменять глобальную запись.
Т.е. есть скажем сайт, который расположен внутри компании, доступ к нему есть как через интернет, так и внутри.
При этом необходимо использовать одно и тоже доменное имя как внутри так и снаружи, как пример: mail.kontora.ru
Также при этом имеется сайт: kontora.ru, который уже расположен на хостинге (вне компании).

Мне на сервере DNS нужно сделать так, чтобы внутри компании mail.kontora.ru, указывал на скажем: 192.168.10.243.
Но если я создаю доменную зону kontora.ru , и в ней добавляю mail (что в итоге дает mail.kontora.ru), при этом перестает работать kontora.ru - как этого избежать?

С Windows DNS - никак. То что вы описываете есть так называемый split-DNS сценарий. Для его реализации вы копируете во внутреннюю зону все записи внешней зоны, меняя при этом IP адреса, которые вам нужно на серые (mail.kontora.ru), и в дальнейшем, при редактировании внешней зоны также не забываете править внутреннюю.

добавьте А запись указывающую на IP kontora.ru на внешнем хостинге.

вы можете добавить этот IP на внешнем ДНС. Но будет работать только для внутренних пользователей, а так же для VPN пользователей.