Просканировав машину я обнаружил открытыми: 135, 1025, 1040. Для чего они нужны и как их закрыть? Есть ли для этих целей программулина (универсальная - чтоб любые порты умела крыть)?

Открытые порты обсуждаем в Инф. Безопасности. Программулина - фаервол (firewall). Их вообще обсуждаем в этой теме. Также рекомендую фильтры в ПО Windows и Инф. Безопасности.