После восстановления файла system перестали запускаться файлы

Недавно неожиданно перестала загружаться Windows XP SP3. Выяснилось, что слетел реестр. Точек восстановления не было, поэтому я заменил файл system из папки C:\WINDOWS\repair. Windows загрузилась, но теперь не запускаются некоторые exe файлы. То есть не запускаются ни одна установленная программа и почти все системные проги, некоторые диалоговые окна. А запускаются, например, "Мой компьютер" и другие окна просмотра папок, диалог свойств панели управления, cmd.exe и др. При попытке запуска консольных программ в командной строке, программы не запускаются, а просто вырубается cmd.exe. Не могу запускается даже Task Manager, чтобы можно было посмотреть, запущенные процессы.
А в безопасном режиме такой проблемы нет, все проги запускаются.