Вин 2003 сервер. Замена винта.
 

Нужно будет поменять винт на Вин 2003 сервер. Винт не системный, файловое хранилище. Основное, что на нем есть - папка размером более 100 Гб с кучей вложенных папок и кучей уровней вложенности. И с назначенными правами пользователей. Если тупо клонировать диск Акронисом - права сохранятся?

Да. Более того, для этого не обязательно пользовться продуктами Acronis. Total Commander умеет копировать папки со всеми разрешениями NTFS.