лишний проход цикла
 

Нужно сделать ряд операций с существующими файлами в каталоге, например создать директории по первым символам названия с небольшими изменениями

всё нормально, только скрипт создаёт 2-е лишнии директории ~0 и 4.txt
полагаю что это сработала команда mkdir ~0,4.txt

куда копать чтоб избавиться от лишней операции ?

как всегда )))
долго думал, а после поста за 5 сек решил )

надо вставить goto :eof после строки с for