индекс программ поврежден
 

Возникла следующая проблема.

Последнее время synaptic стал вести себя неадекватно. Например, при попытке установить или удалить какой-либо пакет, отмечает для удаления кучу несвязанных с ним пакетов.
Видел от него сообщение о том, что индекс программ повреждён.

Возможна проблема возникла из-за что я использую и dpkg, и apt-get, и synaptic.

Можно ли как-то исправить индекс и что он, вообще, из себя представляет? Подскажите, пожалуйста, что делать.

может тут что полезное http://forum.ubuntu.ru/index.php?topic=23506.0
а также man apt-get, man apt-cache, в частности возможно чем-то помогут
apt-get -f check
apt-cache unmet

Я тоже использую иногда и то, и то))) Например, если надо установить программы или пакеты из комплекта дисков с Debian, то использую Synaptic. А если качаю какие то Debian пакеты, то использую dpkg. Так же если ИКСЫ выгружены, то часто пользуюсь aptitude или apt-get, но никогда не повреждались индексы программ. Возможно что в корневом разделе ошибки

Кстати, возможно что когда-то были установлены какие либо пакеты с ошибками, возможно из-за них так же все эти проблемы