Проблемы с собранной системой
 

Когда выключаю компьютер нажатием кнопки Power(до запуска ОС), он включается сам, но не как при нажатии Reset, а кулер перед тем как вновь заработать, выключается и некоторое время крутится по инерции. Выключить комп можно, только отключив блок питания, пока крутится кулер.

Jraah, неправильное подключение выводов с фронтальной панели.

Я был в этом уверен! Несколько раз проверил и несколько раз переподключил

- и всё по-прежнему? Тогда, обнулите CMOS BIOS, перепрошейте стабильной версией BIOS, настройки BIOS SETUP "по умолчанию". Удачи, ;)

Отключите все устройства и попробуйте снова.

Тут надо пробовать рыть в сторону Power Management в BIOS - отключать все, по сигналу чего возможно включение компьютера - параметры типа Wake On LAN / Ring / Modem / Mouse Move и все в таком духе.

Вообще-то ничего крамольного не видно. Новые материнки именно так управляют скоростью вращения вентилятора поцессора.

DVDshnik, так комп же не выключается с кнопки у топикстартера.

Не факт, что и это является неисправностью. Нужна статистика поведения при старте материнских плат этой же модели.