[Telepuzik]

Нет boot.ini содержит только информацию о том где находится та или другая ОС. Файл загрузчика вроде называется ntldr. При установке 2 и более ОС, за загрузку отвечает он. Как точно работает загрузчик незнаю. Но считаю что при установке второй ОС система смотрит есть ли уже установленная ОС, если есть то переписывает себе файл необходимый для загрузки установленной ОС и формирует меню для выбора ОС . При выборе той или иной ОС в меню, загрузчик выбирает соответстующий этой ОС файл загрузки и передает управление иму. Незнаю как в 2003, но более ранние версии Windows должны хранить свои загрузочные файлы в начале Primary раздела диска. (Хотя могу и ошибаться).
Посмотри правильно ли XP создала запись в boot.ini для Windows 2003.