[Jula0071]

Информация кто есть кто в массиве записана в метаданных на самих дисках, порядок подключения к портам неважен. Тем более, что у вас RAID 1 – каждый из дисков содержит полную копию всех данных. Данные не будут потеряны, пока жив хотя бы один из дисков массива.
Есть впрочем небольшая тонкость, если массив софтверный (например, mdadm) и загрузочный, а загрузчик установлен только на один диск, то система не загрузится, если в биосе не указать загрузочным правильный физический диск. Хардверных массивов это не касается, как и fake-raid. С последними, однако, может быть всё что угодно в силу кривизны рук разработчиков драйвера.