[K.A.V.]

Dezmont777, у вас был полный путь, я тестировал с таким же, вот и всё

Что мешает указать переменную программной директории?

Код:

@echo off
set mydir=%ProgramFiles%\
IF NOT EXIST "%mydir%Notepad++" "npp.6.1.6.Installer.exe" /S /D=%mydir%Notepad++