[Telepuzik]

создан RAID1 посредством установленного контроллера Marvell. »

Диагностику тома с данными выполняли? chkdsk что показывает?

[sfap]

Делал проверку раздела, на котором лежат данные. выставил флажки на "исправлять ошибки автоматически" Система сказала, что проверит после ребута. Перезагрузил, диск проверялся, к стати один из этапов проверки был "проверка дескрипторов файлов". После проверки система просто загрузилась, никакого сообщения, типа были найдены и исправлены ошибки не было.
Или нужно загрузиться с диска, выбрать пункт "восстановление системы", и из консоли восстановления делать chkdsk?

[Petya V4sechkin]

на рабочих станциях с Windows7

При отключенном UAC то же самое?

Пробовал загрузить сервер в защищённом режиме с поддержкой сети- сервер до конца не загрузился, т.е не предложин нажать CTRL+ALT+DEL, но файловый сервер был доступен, и файлы копировались с него нормально.

На сервере попробуйте KB948496 на всякий случай.

[Iska]

никакого сообщения, типа были найдены и исправлены ошибки не было. »

Ищите в журналах событий.

[sfap]

На сервере попробуйте KB948496 на всякий случай. »

Установил - не помогло.

При отключенном UAC то же самое? »

Тоже не помогло.
Т.к при загрузке в защищённом режиме файлы копируются нормально на машинах с Windows 7, есть основания полагать, что загружается что-то лишнее.
Киньте, плиз ссылкой на инфу о том, что должно быть в автозагрузке Windows 2003R2, чтобы всё остальное можно было считать "лишним", и отрубить.

[monkkey]

что должно быть в автозагрузке Windows 2003R2 »

Ничего.

[sfap]

Спрошу по-другому:
Мне следует искать проблему здесь:

HKEY_LOCAL_MACHINE \ SYSTEM \ CurrentControlSet \ Services
или есть ещё ветки реестра, на которые стоит обратить внимание? Учитывая, что в защищённом режиме работает нормально, причиной явно является что-то лишнее при загрузке.