[kotkovets]

но тогда как решить проблему невозможности закрытия окна cmd до завершения процесса? »

Я себе делаю так, запуск скрытно все, что можно, с ожиданием:

Код:

Outfile ostart_.exe

!define hideexec "!insertmacro func_hideexec"
!macro func_hideexec exehide
      System::Store S
      System::Alloc 72
      Pop $2
      System::Call "*$2(i72,i,i,i,i,i,i,i,i,i,i,i3)"
      System::Call "*(i,i,i,i)i.r3"
      System::Call 'kernel32::CreateProcess(i0,t"${exehide}",i0,i0,i0,i0,i0,i0,ir2,ir3)i.r4'
         System::Call "*$3(i.r1)"
         System::Call "kernel32::WaitForSingleObject(ir1, i-1)"
      System::Call "kernel32::CloseHandle(ir4)"
      System::Free $2
      System::Free $3
      System::Store L
!macroend

Section
  ${hideexec} "C:\123.bat"
SectionEnd

В батнике можно прописать в конце exit или прибивать в конце cmd