вот что получилось в итоге:
#NoTrayIcon
#include <Array.au3>
#Include <FileOperations.au3>
$sPath = "E:\test\source"
if Not FileExists($sPath) then
MsgBox(64, "Ошибка", "Не найден каталог: " & @CRLF & $sPath)
Exit
EndIf
$dPath = "C:\test\destination"
if Not FileExists($dPath) then
DirCreate($dPath)
EndIf
$Level = 5 ; уровень вложенности каталогов
$Exclude = "*.zip|*.7z" ; исключить файлы с расширением zip и 7z
$a1FileList = _FO_FileSearch($sPath, $Exclude, False, 0, 1, 1, 0)
For $i=1 To $a1FileList[0]
FileCopy($a1FileList[$i], $dPath)
Next
$aFolderList = _FO_FolderSearch($sPath, "*", True, $Level, 0, 1, 0)
For $i=1 To $aFolderList[0]
DirCreate($dPath & "\" & $aFolderList[$i])
$a2FileList = _FO_FileSearch($sPath & "\" & $aFolderList[$i], $Exclude, False, 0, 1, 1, 0)
For $j=1 To $a2FileList[0]
FileCopy($a2FileList[$j], $dPath & "\" & $aFolderList[$i])
Next
Next
Exit